微生物菌剂由能够防病促生长的多种高效菌株经现代发酵工艺复配而成，通过微生物功能菌株在作物根表、根际和体内定植、繁殖和转移，充分发挥菌株的促长、固氮、解磷、解钾、抗病、抗逆和改良土壤等功能，有效预防根腐病、枯萎病、黄萎病、立枯病等多种土传病害，从而达到增产、防病、改善品质和提高肥料利用率等功能。按剂型可分为：液体、粉剂、颗粒型；

按内含的微生物种类或功能特性可分：为根瘤菌菌剂、固氮菌菌剂、解磷类微生物菌剂、硅酸盐微生物菌剂、光合细菌菌剂、有机物料腐熟剂、促生菌剂、菌根菌剂、生物修复菌剂等。

按照复合方式分为：微生物菌剂和复合微生物菌剂（JT微生物菌剂）